1بیماری کووید-19 در سطح جهان گسترده شده و منجر به میزان قابل ملاحظه ای از موارد ابتلا و مرگ ومیر در دنیا شده است. کووید-19 عمدتا به عنوان یک بیماری تنفسی در نظر گرفته می شود، با این حال از آنجایی که کروناویروس سندرم حاد تنفسی 2 (SARS-CoV-2) می تواند از طریق گیرنده خود یعنی آنزیم مبدل آنژیوتانسین-2 که به فراوانی در کلیه ها حضور دارد، وارد سلول های کلیوی شود، کلیه ها نیز ممکن است به عنوان یکی از اهداف مهم عفونت کروناویروسی در نظر گرفته شوند. پیگیری و تحت نظر قرار دادن بیماران مبتلا به کووید-19 از لحاظ بروز آسیب های کلیوی حایز اهمیت می باشد و اقدامات درمانی به موقع باعث حصول نتایج بالینی بهتر خواهند شد. آسیب کلیوی القا شده توسط SARS-CoV-2 چندعلیتی می باشد. این ویروس مستقیما قادر است تا سلول های توبولار پروگزیمال و پودوسیت های کلیوی را آلوده کرده و براساس مسیر آنزیم مبدل آنژیوتانسین-2 می تواند منجر به نکروز حاد توبولار، ترشح پروتیین در داخل کپسول بومن، گلومرولوپاتی و آسیب میتوکندریایی شود. از تنظیم خارج شدن پاسخ های ایمنی ناشی از کروناویروس که شامل طوفان سایتوکینی، سندرم فعال سازی ماکروفاژ و لنفوپنی می باشد نیز از دیگر عوامل ایجاد آسیب حاد کلیوی محسوب می شوند. همچنین برهم کنش بین ارگان های بدن، اختلال در عملکرد اندوتلیال، افزایش فعالیت انعقادی، رابدومیولیز و سپسیس نیز از مکانیسم های بالقوه دیگر در ایجاد آسیب حاد کلیوی می باشند. نوشتار حاضر به بررسی نقش هر کدام از عوامل فوق در بروز آسیب حاد کلیوی در بیماران مبتلا به کروناویروس می پردازد.

بیماری مجهول اصطلاحی است که توسط سازمان جهانی بهداشت در سال 2018 توسعه پیدا کرده است که شامل یک پاتوژن مجهول با قابلیت اپیدمی یا پاندمی باشد. با توجه به همه گیری پاندمی ایجاد شده توسط کروناویروس جدید که در واقع یک عامل ویروسی جدید و ناشناخته است، تصور می شود که کروناویروس جدید اولین بیماری مجهولی باشد که توسط سازمان جهانی بهداشت پیش از وقوع درباره آن هشدار داده شده است. بر اساس اعلان سازمان جهانی بهداشت در سال 2018، پنومونی ووهان که توسط یک عامل ناشناخته ایجاد شد، باید به عنوان اولین بیماری مجهول شناخته شود. این عامل بیماری‍, زا بعدا با عنوان کروناویروس جدید (2019-nCov) معرفی شد. تعیین توالی ژنوم این ویروس و بررسی آن نشان دهنده شباهت 5/79 و 96 درصدی آن به ترتیب به SARS-CoV و کروناویروس های مرتبط با SARS خفاش (SARSr-CoV-RaTG13) است؛ این شباهت پیشنهاد می کند که این ویروس احتمالا منشا گرفته از خفاش است. ویروس با نرخ بالای انتقال انسان به انسان (R0)، به سرعت در چین و سایر کشورها منتشر شده است، که تا 8 فوریه 2020 تعداد 34953 مورد تایید شده مبتلا و 725 مرگ ناشی از آن گزارش شده است که نشان دهنده نیاز فوری برای توسعه عوامل پیشگیرانه و درمانی در برابر این ویروس است. این مطالعه پیشنهاد می کند نام 2019-nCoV برای ویروس جدید به کروناویروس سندرم حاد تنفسی مسری (TARS-CoV) تغییر یابد و همچنین مروری دارد بر پیشرفت های ایجاد شده در زمینه تحقیق و توسعه آنتی بادی های ایمنی زا (Neutralizing antibody) و واکسن هایی که دومین متصل شونده به گیرنده (RBD) (Receptor-binding domain) را مورد هدف قرار می دهند و مهار کننده های اتصال ویروسی که دومین تکرار شونده هفت تایی 1 (HR1) (Heptad repeat 1) را در پروتئین اسپایک کروناویروس جدید هدف قرار می دهند.

سابقه و هدف: شبه ویروس ها به دلیل ایمنی و تطبیق پذیری، ابزار مفیدی برای ساخت واکسن ها و داروهای درمانی، به ویژه برای ویروس های نوظهور هستند. SARS-CoV-2 به دلیل مرگ ومیر بالا و انتقال راحت، باید تحت شرایط ایمنی زیستی سطح سه قرار گیرد که همین موضوع روند ساخت واکسن ها و داروهای درمانی را در بسیاری از مراکز تحقیقاتی، دشوار کرده است. هدف از این مطالعه تولید سودوتایپ لنتی ویروس است که در تست خنثی سازی ویروس بر مبنای شبه ویروس در شرایط سطح ایمنی زیستی دو، بتوان از آن استفاده کرد. مواد و روش ها: روی ژنوم HIV-1، ژن پروتئین اسپایک SARS-CoV-2 قرار داده شد. برای تأیید ورود از تست های فلوسایتومتری، میکروسکوپ الکترونی و ایمونوفلورسانس استفاده شد. در نهایت، قدرت خنثی سازی سرم بیماران بهبودیافته از کووید19 با استفاده از تست خنثی سازی ویروس بر مبنای شبه ویروس اندازه گیری شد. یافته ها: نتایج تست های فلوسایتومتری، میکروسکوپ الکترونی و ایمونوفلورسانس ورود ژن اسپایک را تأیید کرد. همچنین، سرم بیماران بهبودیافته قدرت خنثی کنندگی بسیار بالاتری را نسبت به سرم گروه کنترل مواجه نشده با SARS-CoV-2 نشان داد. استنتاج: نتایج این مطالعه نشان داد که با استفاده از سودوتایپ لنتی ویروس تولید شده می توان قدرت خنثی کنندگی سرم بیماران را اندازه گیری کرد و تست خنثی سازی ویروس بر مبنای شبه ویروس، جایگزین مناسبی برای تست خنثی سازی ویروس بر مبنای ویروس زنده SARS-CoV-2 است. همچنین، این تست می تواند در مطالعات ارزیابی واکسن ها یا داروهای درمانی برای مبارزه با این ویروس کشنده کارآمد باشد.

مقدمه: بیش از دو سال از شیوع سندرم حاد تنفسی ویروس کرونا 2 (SARS-CoV-2) در ووهان چین می گذرد. SARS-CoV-2 یک پاندمی بی سابقه (COVID-19) در عصر مدرن ایجاد کرده و تمام ساختارهای علمی، اقتصادی و اجتماعی جهان را به چالش کشیده است. تحقیقات گسترده ای در سراسر جهان برای مطالعه ساختار و عملکرد پروتئین اسپایک SARS-CoV-2 از ابتدای پاندمی انجام شده اند. بنا بر مطالعات مختلف، نقش و اهمیت پروتئین اسپایک در ورود SARS-CoV-2 به سلول های انسانی ثابت شده است. ازجمله عوامل مهم و مؤثر در کنترل همه گیری کووید-19، درک تغییرات ساختاری پروتئین اسپایک در واریانت های ویروس و اثربخشی داروها و واکسن ها در برابر واریانت های جدید SARS-CoV-2 است. با توجه به اهمیت فراوان پروتئین اسپایک SARS-CoV-2، سعی شد در این مطالعه ساختار و تعامل آن با گیرنده های سلولی با استفاده از ابزار بیوانفورماتیک بررسی شود. علاوه بر این، اثر داروها و واکسن های موجود بر وارینت های مختلف SARS-CoV-2 بررسی شد.مواد و روش‏‏ها: روش های بیوانفورماتیک و داکینگ مولکولی برای مطالعه عملکرد اتصال پروتئین اسپایک به گیرنده های سلولی مختلف آن در بدن انسان استفاده شدند. برای انجام فرایند داکینگ مولکولی از وب سرور HDOCK و در مرحله بعد از وب سرور PDBsum برای بررسی های پس از داکینگ و اطمینان از صحت داده های به دست آمده استفاده شد. همچنین از نرم افزار PyMOL برای مطالعه و تجسم جهش های جایگزین و حذف در پروتئین اسپایک استفاده شد.نتایج: تفاوت در پروتئین اسپایک واریانت های SARS-CoV-2 با تصویرسازی های انجام گرفته، توسط نرم افزار PyMOL مقایسه شد. داده های حاصل از جهش های گسترده در پروتئین اسپایک واریانت اومیکرون نشان دهندة نوعی بازطراحی دوبارة پروتئین اسپایک بود. این جهش های وسیع، تغییرات گسترده ای در ساختار و عملکرد پروتئین اسپایک به همراه دارد. براساس داده های حاصل از داکینگ مولکولی و مقایسه میزان سطح انرژی (امتیاز داکینگ) اتصال پروتئین اسپایک واریانت های مختلف ویروس با گیرنده های مختلف نشان دهندة بالابودن تمایل اتصال - با سطح انرژی پایین تر و پایدارتر پروتئین اسپایک - با گیرنده KREMEN1 نسبت به گیرنده اصلی ACE2 است. میزان سطوح انرژی اتصال پروتئین اسپایک در واریانت های مختلف ویروس با سایر گیرنده ها غیر از گیرنده KREMEN1 تقریباً مشابه بود یا اختلاف اندکی با سطوح انرژی اتصال پروتئین اسپایک در واریانت های مختلف ویروس با گیرنده اصلی ACE2 دارد.بحث و نتیجه‏ گیری: تفاوت زیادی در تمایل اتصال پروتئین اسپایک واریانت های نوظهور و مهم ویروس (اصلی، آلفا، دلتا و اومیکرون) با گیرنده ACE2 وجود ندارد؛ اما میزان تمایل اتصال به گیرنده KREMEN1، رو به افزایش و در واریانت دلتا به اوج خود رسیده است. سطح انرژی اتصال پروتئین اسپایک به گیرنده KREMEN1 به طور محسوسی نسبت به سایر گیرنده ها منفی تر بوده و این نشان دهندة ایجاد اتصالات و پایداری بیشتر است. با توجه به سطح انرژی های دریافتی از وب سرور HDOCK، می توان نتیجه گرفت اگرچه گیرنده ACE2 گیرنده اصلی پروتئین اسپایک نام گرفته است، همچنان گیرنده های دیگری نیز با پایداری خوبی می توانند به پروتئین اسپایک متصل شوند. براساس اطلاعات موجود، تاکنون هیچ گزارشی مبنی بر انجام فرایند داکینگ بین پروتئین اسپایک با سایر گیرنده های غیراصلی پروتئین اسپایک (AXL، ASGR1 و KREMEN1) صورت نگرفته است؛ بنابراین، برای تأیید یا رد این یافته ها باید پژوهش های جامع تری انجام شود.

سندرم تنفسی شدید حاد (سارس) یک بیماری عفونی جدید است که نخستین بار در اواخر فوریه (اوایل اسفند 2003) هنگامی که موارد پنومونی اتیپیک با علت نامعلوم در بین کارکنان بیمارستانی در هانوی ظاهر شد، به آن پی برده شد. طی دو هفته، طغیانهای مشابهی در بیمارستانهای مختلف هنگ کنگ، سنگاپور و تورنتو روی داد....

بیماری کووید-19، ناشی از کروناویروس2 سندرم حاد تنفسی انسان، از شهر ووهان در چین شروع شد و در کل جهان گسترش یافته است. با استفاده از تحلیل تبارشناسی شبکه ای برای کروناویروس2 سندرم حاد تنفسی، سه سویه اصلی متمایز از نظر اسیدآمینه یافت شده است و آنها را A، B و C نامگذاری کرده اند. سویه A سویه نیایی است. سویه های A و C بیشتر در خارج از آسیای شرقی در اروپا و آمریکا یافت می شود در حالی که سویه B معمول ترین سویه در آسیای شرقی است. نیاز ضروری دنیا در حال حاضر توسعه فوری روش های کارآمد برای محافظت از مردم در برابر خطر بالای سرایت این بیماری است. سازمان جهانی بهداشت پژوهش ها را در زمینه تشخیص بیماری، تولید واکسن و درمان برای این کروناویروس جدید سرعت بخشیده است. استراتژی های مختلف برای جلوگیری از انتقال و آلودگی به این پاتوژن تنفسی شامل حفظ سلامتی با روش های غیردرمانی و محافظت اختصاصی از طریق پیشگیری شیمیایی یا پیشگیری ایمنی است. افراد آلوده به کروناویروس2 منبع اصلی آلودگی هستند. مورد تایید شده ای از کووید-19 گزارش شده است که تست سوآپ حلقی وی برای RNA کروناویروس2 سندرم حاد تنفسی در دوران نقاهت دوباره مثبت شده است. این مورد اهمیت شناسایی RNA کروناویروس2 سندرم حاد تنفسی را برای ارزیابی آلودگی به ویروس نشان می دهد.

سندرم حاد تنفسی شدید، بیماری عفونی نوپدیدی می باشد که به دنبال موارد اولیه از ایالت گوانگ دونگ چین، منجر به همه گیری جهانی بیماری شد. این بیماری از طریق مسافران، سریعا به سایر نقاط جهان گسترش یافت. در ابتدا عامل بیماری ناشناخته بود ولی با توجه به گسترش سریع بیماری، یک عامل عفونی احتمالی برای آن در نظر گرفته شد که از قابلیت انتقال بالایی برخوردار بود. با اقدامات به عمل آمده توسط تیم مرکز کنترل و پیشگیری آمریکا (CDC) و سازمان بهداشت جهانی (WHO)، یک عامل ویروسی متعلق به گروه کروناویروسها ولی با خصوصیات ژنتیکی کاملا متفاوت از سایر کروناویروسها، از نمونه های بیماران مبتلا جدا شد. این ویروس جدید، در عرض چند هفته، تقریبا اکثر کشورها را فرا گرفت و در عرض مدت کوتاهی در ماههای مارس و آوریل 2003 به اوج خود رسید. این اپیدمی، بار مالی فراوانی را برای کشورهای درگیر علی الخصوص کشورهای شرق آسیا به همراه داشت. سرانجام در ماه جولای، اپیدمی کنترل شد. ولی آیا این واقعا پایان یک همه گیری بود؟ پاسخ به این سوال بسیار مشکل است. با توجه به این که این بیماری یک بیماری نوپدید می باشد و احتمال بروز مجدد بیماری وجود دارد، شناخت موارد مشکوک از نظر علایم کلینیکی و آزمایشگاهی، نحوه برخورد با این بیماران، نحوه انتقال بیماری، توصیه های لازم جهت کنترل این عفونت، توصیه های ضروری قبل از مسافرت به مناطق آلوده و نیز پس از بازگشت از این مناطق و گزارش موارد مشکوک در سیستم های بهداشتی بر همه پزشکان لازم است. در این مقاله مروری به بررسی اطلاعات موجود به دست آمده از منابع مختلف در مورد این بیماری نوپدید خواهیم پرداخت.

زمینه و هدف: تاکنون موفقیت چشمگیری در زمینه درمان اختصاصی عفونت های کروناویروس حاصل نشده است. با توجه به اینکه داروهای گیاهی اثرات مفیدی دارند، استفاده از ترکیبات گیاهی موجود می تواند در عفونت خفیف ویروس کرونا موثر باشد. هدف از این مطالعه، مرور تحقیقات اخیر در خصوص اثرگذاری داروهای گیاهی در مهار کروناویروس های انسانی و افزایش سطح آگاهی برای استفاده از ترکیبات گیاهی به عنوان داروهای حمایتی در کاهش شدت عفونت های کروناویروسی می باشد. مواد و روش ها: پایگاه داده پاب مد برای جستجوی مقالات حاوی عبارت های کروناویروس، سارس، مرس و همچنین انسان و طب گیاهی استفاده شد. معیار ورود، تمام مقالات کامل با کلید واژه های ذکر شده و معیار خروج، مقالات خلاصه و مقالات ارایه شده در همایش ها بود. در مجموع 35 مقاله در مورد کرونا ویروس های انسانی یافت شد. اکثر مطالعات در مورد کووید با تعداد 17 مقاله (48/57 درصد) بود. هشت مقاله (23/85 درصد) در مورد سارس و تنها یک مقاله (2/85 درصد) در مورد مرس یافت شد. نه مقاله (25/71 درصد) در مورد سایر کروناویروس های انسانی جستجو و مورد استفاده قرار گرفت. یافته ها: برخی از ترکیبات کلیدی که برای درمان بیماری های کرونا ویروسی در انسان موثر هستند شامل اسکوتلارئین، سیلوسترول، تریپتانترین، سایکوساپونینB2، لکتین هایی مانند گریفیتسین، لیکورین و پلی فنول ها از جمله کورستین، میریستسین، کافئیک اسید و ایزوباواچ است. انجام آزمایش های بالینی روی انسان، آزمایش های برون تنی و درون تنی برای تعیین سطح ایمنی و همچنین تعیین سطح درمانی برای هر ترکیب مورد نیاز است. نتیجه گیری: اگرچه برخی از ترکیبات گیاهی برای استفاده در درمان کرونا توصیه شده است، اما مطالعات اولیه می تواند بر روی ترکیباتی متمرکز شود که قبلاً برای استفاده دارویی تأیید شده اند. امید است با استفاده از اطلاعات ارائه شده در این مرور، محققان از مشتقات ترکیبات گیاهی در فرآیند تولید داروهای ایمن و موثر ضد کروناویروس های انسانی به ویژه سارس، مرس و کووید 19 استفاده کنند.

انجام هرگونه پژوهش، پیرامون کروناویروس جدید (SARS-CoV-2)، یا نوع جهش یافته آن که با القای طوفان سیتوکاینی (Cytokine storm) در افراد، منجر به بروز سندرم حاد تنفسی می شود و خسارات جانی و اقتصادی زیادی را در طی یک سال اخیر به دنیا تحمیل کرده است، ضروری است. استعمال دخانیات یکی از مهمترین عوامل خطر ساز شناخته شده در بروز بیماری-های شدید دستگاه تنفسی و حتی مرگ ناشی از آن است. بر اساس مطالعات، حدود 1/4 تا 18 درصد از بستری های ناشی از کووید-19 متعلق به افراد سیگاری است، بطوریکه هم دستگاه تنفسی فوقانی و هم تحتانی در افراد سیگاری بیشتر تحت تاثیر عفونت ناشی از کووید-19 قرار می گیرد. همچنین در این افراد نسبت به افراد غیرسیگاری، احتمال بروز علائم شدیدتر تنفسی ناشی از بیماری کووید-19 بیشتر است. لذا در یک سال اخیر هدف اصلی محققان، ارائه توصیه راهکارهای پیشگیری کننده و درمانی برای افراد با بیماری های زمینه ای و در معرض خطر است. مطالعه حاضر نیز در این راستا با هدف تعیین مکانیسم اثرات برگشت ناپذیر مصرف سیگار بر تشدید بیماری عفونی نوظهور کووید-19 و مقایسه آن با میزان شیوع این بیماری در افراد غیرسیگاری بر روی سیستم تنفسی انجام گرفت.